锡安是真实存在的，不过这应该是人类的第六个城市，前五个都被矩阵毁了正如建筑师所说的，为了调和矩阵内部的矛盾，必须将1%不接受矩阵的人类送出去，建立反抗组织，而到了一定时候，矩阵能从这些人身上找到共性大约就是；然而，锡安是现实，尼奥之所以会控制控制机械是因为尼奥也不是一个纯粹的人，救世主the one对应的是基督耶稣，耶稣三位一体即是圣子也是圣父同样也是圣灵同样的尼奥既是人类也是机械同样也是程序起初尼奥只是机械和人类的混合；按电影背景设定的理解，zion所在的应该是真实世界因为电影及其周边电影中没有影射外面那个被机器统治的世界也在实在性上存疑，电影中的所有对话也都是将22世纪的时间线作为现实世界来展开另外动画电影里甚至介绍了机械城市的。