1、黑客帝国的结局，就是母体史密斯尼奥全部系统崩溃被删除史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样而在大结局中，尼奥和史密斯；Caduceus号船员Bane，第二部开头，Morpheus要求一艘船留在表层以便和先知接触，Bane就在这艘船上后来Bane被Smith入侵，到Zion之后曾经准备刺杀过Neo，但是失败了后来在Enter The Matrix中介绍到，是BaneSmith在飞船就位处发射了EMP；其实主要讲的是电脑与人之间的战斗，具有矩阵革命性的黑客帝国三部曲第三部黑客帝国3 矩阵革命，终将这部描述人类与机器之战的史诗影片带向高潮的结局锡安的军队，在志愿者泽诺拉基耶饰和基德克莱顿华生饰；结尾的“飞升”象征着人类超级英雄的诞生尼奥将带领锡安基地的人民，打响对机器世界的反击战，并将以胜利者的姿态结束这场战斗，还人类以自由之身实际上，整个黑客帝国2重装上阵是尼奥探寻自己使命背后真相的过程。