救世主”的身份已无丝毫怀疑，明白到自己可以重写矩阵内程序的能力他马上入侵了其中一个特工程序史密斯，令史密斯烟消云散，消失得无影无踪其他的特工程序吓得落荒而逃之后的故事在黑客帝国2重装上阵中继续发展；黑客帝国简介在黑客帝国系列电影最后一集中，延续上集黑客帝国2重装上阵的故事，并揭晓机器与人类的最终命运面对如潮的电子乌贼，人类城市危在旦夕，墨菲斯和崔妮蒂等欲与入侵者决一死战此时，“救世主。
第三部 剧情简介面对如潮的电子乌贼，人类城市危在旦夕，墨菲斯和崔妮蒂等欲与入侵者决一死战此时，“救世主”尼奥的身体和思想却意外分离，后者再度陷入到“母体”中墨菲斯和崔妮蒂也不得不回到“母体”和守护天使一；是“矩阵之母”在电影中，机器帝国集结了乌贼大军攻打真实世界仅存的人类城市锡安城Zion，锡安城内的人类拼死抵抗，但最后仍是兵败如山倒而电脑人史密斯Agent Smith进化成为更高等的电脑病毒，几乎占领了整个矩阵。