随着一年来的发展与积累，蜂云TMS现已推陈出新了十二个各具特色的功能模块，通过这些模块的相互衔接形成一个立体化的物流协同体系。这套体系可将供应链中的各个环节完美链接在一起，形成一个基于核心流程的、平衡共赢的在线生态系统。
1.订单管理模块
订单管理模块可帮助物流公司快捷的查询及受理客户的网上订单。用户可将托运时间、企业、人员及收发货人等订单信息进行实时编辑，并支持订单的批量导入导出、以及按照特殊规则的分割及归类。
2.运单管理模块
运单管理模块可完成对已承运货单的收件、发车、到站、签收、回单等一系列操作流程，并可在后台自动生成物流跟踪日志。不仅如此还可进行运单审核、查询、计费、打印等系列操作，将运单管理模式化、流程化，极大的提高了运单流转效率。
3.外包管理模块
外包管理模块应用于发货人外包给承运商的使用场景。在此模块中用户可将外包订单与外包运单进行分别管理，并可方便的录入及编辑中转外包所需的专线公司、单号、转货地址、运费、联系方式等信息，并可进行查询和跟踪。
4.调度管理模块
调度管理模块基于委托规则、调度规则等自动或手工完成对运输执行过程的监控，将开单、收件、发车、签收等轨迹更清晰的展现的用户面前。并可对订单的发运时间、节点到货时间、POD签收时间、运行轨迹等各环节均进行监控。
5.核算管理模块
核算管理模块可提供核算及审核管理，企业可使用此功能对车辆的出车天数、油耗、过路费、补贴等相关费用进行统计及核算，将车辆调度及各类费用通过表格形式清晰展示。
6.车辆管理模块
车辆管理模块可对已有车辆建立档案，包括车型、结构、载重、年检、保险、保养等信息。 同时可应用北斗模块对车辆进行调度与监控，并提供区域、超速、疲劳、开门等报警信息。
7.客户管理模块
客户管理模块可完成对已与物流公司建立关联的客户的管理，并可根据客户名称、客户经理、受理网点等信息进行筛选查询。并可根据客户需求生成对账单据用于统计及结算。
8.承运商管理模块
承运商管理模块具备承运商资料编辑及维护功能。在此模块可查看承运商的基础信息及优势专线运力、线路运价等，方便用户选择优质承运商，合理分配业务。
9.统计报表模块
统计报表模块可针对用户所需的里程及日程数据生成相关报表，方便统计及核算。并可根据运输时间、托运企业、运单状态等信息检索并导出所需运单报表。
10.专线管理模块
在专线管理模块可对各条专线进行价格时效查询。用户进入专线管理模块后，可通过选择始发地及目的地进行搜索，查询所选城市之间价格、时效等各类信息。
11.网点管理模块
在网点管理模块可方便的进行网点区域及联系方式查询，通过选择所属区域及联系电话等信息，查询所选网点区域、详细地址及运营详情等其他信息。管理员也可对网点地址在地图上进行定位，方便用户查询网点位置。
12.用户权限模块
在用户权限模块，管理员可为该企业下不同部门设定不同角色。不同的用户权限可使用不同的模块进行相应的操作，使整个运输流程更加分工明确、条理清晰。
蜂云TMS一直致力于搭建企业间快捷沟通和协同的基础设施，通过这十二个功能模块，蜂云TMS在云端构建了一个庞大的社区，供应链上不同层次的企业与体系可以达到真正的互联互通。