墨菲斯没死，变成了程序流程得到储存，并且还根据一种方法遮盖到一个特工程序流程的身上，造成一个特工倒戈，这一倒戈特工名称叫阿诗丹顿巴格斯第一眼看见的外观设计实际上并并不是尼奥，反而是另一个人，暗示着尼奥的。
由于战力相差悬殊，眼看人类就要灭族，救世主尼奥the One以彻底清除史密斯变异病毒为条件，要求机器大军撤军，与人类维持和平尼奥自认为最终与机械达成共识，在母体内部与史密斯发生激烈战斗最终尼奥选择了自我牺牲，清除了。
请点击输入图片描述 镜头切换，一个长相酷似尼奥的人姑且继续称他是安德森在做游戏开发，似乎还是个VR游戏 请点击输入图片描述 请点击输入图片描述 可以看到他开发的游戏就是黑客帝国，而且还得了很多奖，游戏最早发布时间就是1999年。
20年前的第一集中，neo和mophes的穿越时空的对谈，如今通VR头盔，都能实现了，导演对于世界观的解释，才是此系列值得看反复看，反复回味的核心剧情介绍 故事承接黑客帝国3矩阵革命，尼奥和崔妮蒂将以某种方式复活。
根据上部影片的结局来看，救世主复活绝非偶然尼奥的躯体并没有被毁灭，预示着尼奥终究会复活卷土重来，为后面的人类与电子机械大战的开展作铺垫二黑客帝国4救世主复活，承上启下前情回顾，在人机博弈过程中，史密斯被。
