1、从尼奥和先知的对话中知道架构师不仅不理解爱，更不理解选择，所以架构师不理解为什么尼奥宁可做出会毁灭人类的“错误”决定也要救崔妮蒂尼奥的选择终结了矩阵升级锡安毁灭重建的循环，但却迎来了另一个问题，如果尼奥不进入；这个世界崩溃过很多次，锡安被毁灭过很多次，而尼奥是触发点，尼奥再锡安的世界也能使用超能力，说明这个世界也只是程序而已，包括他的眼睛瞎了后，依然能看到代码机器需要自主进化升级，它不具备这个能力，人类具备，所以它；第三个人认为，电脑圈养人类的目的，就是利用人类的创造性，毕竟电脑创造力不是强项，那有成千上万的人类创造力强圈养起来，科技才能快速发展总的来说，锡安已经被摧毁过几次了，作为发现了很久的电脑，不可能没有；由于机械帝国建立以后，综合国力远远的超出了人类的想象无论是机械帝国的经济发展还是说起强大的生产能力，都不是任何其他国家所能相媲美的，严重威胁到了人类国家的未来在这种情况之下，为了让机械帝国失去支撑其国家的能量。
2、3母体为什么要毁灭锡安？母体知道有特警病毒威胁他，为什么他还要毁灭锡安？若救世主不去那机械城市，在锡安被杀了，母体也会完蛋啊？！是母体系统的逻辑规则一定要这样做么？如果是威胁救世主来机械城市，但那机械城市的BOSS为什么一开始又说；1感觉不懂你的意思，史密斯要获得自由不过史密斯所在的Matrix就是机械帝国的程序，似乎他们几百年来一直想毁灭人类 2锡安是现实中的城市，你说的密码是从Matrix 进入锡安看看关于Matrix中的救世主 Matrix是一个建立在数学；然后在锡安必毁，人类必定灭亡的情况下，由造物者和救世主做一个交易机器帝国毁灭锡安，但是救世主可以选几个男女重建锡安，保证人类种子不会毁灭，而救世主返回源代码，母体重启这样既保证了救世主不会因为超级用户的权利过；刚看了黑客帝国介绍，有一个问题不明白，矩阵的设计师为什么要制造“救世主”来建造锡安，返回来攻打自己？ 刚看了黑客帝国介绍，有一个问题不明白，矩阵的设计师为什么要制造“救世主”来建造锡安，返回来攻打自己？ 展开；尼奥明白了以上事实，也就获得了在锡安世界中的超能力单手挡机械乌贼，在第三部中在机械城与系统核心作了交易，即帮系统干掉史密斯，同时保存锡安世界而不将其毁灭最后尼奥和史密斯同归于尽共同湮灭，系统顺利完成升级。
3、首先，锡安从未被摧毁过第三部里面那次战争是母体进攻的最深入的唯一的一次而且第三部，母体问尼奥想要什么，尼奥说想要和平最后的母体和先知说话时并没有确定和平到底能持续多久也就是说，这是个轮回前面N个尼奥；锡安主机密码就是电脑系统里的开机密码，一旦史密斯得到了密码，就能入侵锡安，摧毁锡安的防御系统，这样机器大军就能长驱直入，毁灭锡安黑3中不是有一节，人类大军和机器大军正面战斗的片段吗如果墨菲斯说出锡安主机的；那是程式造出来要维持世界平衡的法则 但是先知知道这件事想打破规则 於是引来尼欧一干人 然后相信尼欧会跟之前的救世主不一样 史密斯是在后来产生的病毒 而且它变得愈来愈强大，甚至想要压过母体操控这个世界 想要毁灭锡安 so；之后救世主再按照初始设定再带着16女7男返回真实世界，再重建锡安，等待下一代救世主，这就是为什么“先知说升级有什么好处，只不过死很多人”的原因，因为每次完成一次升级，代价就是锡安被摧毁一次。
4、剧情漏看了吧，当时出动了两艘船去搜索墨菲斯的船，一共有三艘流落在外，其馀，基地里的所有船，都被史密斯同化的那个家伙破坏了，锡安内并没有可以释放电磁波的船又因为这东西敌我无差别攻击，在基地内使用就会使所有的；其实最开始的答案并没有错锡安是被摧毁了五次，每次救世主可以救出一部分人使得人类可以继续繁衍，这样就能让机器世界在研究人类中不断改进，同时，为了不使得人类有同机器抗衡的可能，机器世界又每次在100年后毁灭锡安一次；他也有着一定的内线进攻技巧，抛投背打小勾手，可以让他在内线为所欲为，是联盟极具毁灭性的内线攻击手但过于出色的身体天赋，也成了锡安成长路上的阻碍，他太过于依赖这幅身体，以至于只会内线进攻，外线威胁全无。
