最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对尼奥的承诺允许那1%的人类永久的生存在锡安中，先知的矩阵革命得以实现最终先知和尼奥共同拯救了人类经典的黑客帝国系列完结；不能说活着，但应该也不是死了吧，毕竟他的存在就是为了修复母体，重建ZION，就如前5任救世主所做的一样，但是因为他有爱，和别人不一样，他才选择了和别人不一样的道路所以应该也不能算个真实存在的吧倒下去以后；虽然眼睛被弄瞎了，但是他身为救世主的能力被完全激发，得以冲破机器帝国的重重封锁，争取到与一个与机器帝国谈判的机会，史密斯就是因为尼欧的力量才衍生出来的，可以理解为是一中在母体里肆意妄为的病毒，而尼欧就是他唯一的；其实主要讲的是电脑与人之间的战斗，具有矩阵革命性的黑客帝国三部曲第三部黑客帝国3 矩阵革命，终将这部描述人类与机器之战的史诗影片带向高潮的结局锡安的军队，在志愿者泽诺拉基耶饰和基德克莱顿华生饰；尼奥Neo最后死掉了他用自己的牺牲换取“真实世界”短暂的和平与安宁电影里一再交代，只要拔下插头就会死掉那个机器帮他把插头拔掉他和同化的“史密斯”一起消失黑客帝国3矩阵革命The Matrix Revolutions。
黑客帝国3结局解析如下黑客帝国3以主要人物尼奥史密斯双双衰亡，整个系统崩溃为结局结局中史密斯感染了尼奥设下的病毒，机器大帝因此掌握了删除史密斯和尼奥方法，最后尼奥进入矩阵注入了大量的删除代码，导致尼奥的；直到尼奥在第三部中求教先知才得知答案让我们整理下Architect与先知说过的话设计师对尼奥说“你是母体中一些不平衡的方程中不平的那部分，是异常的集合”先知对尼奥说“他”不能理解任何人的选择，他的使命就是平衡。
无所谓“死”不死的 NEO本来也是程序的一部分 工程师创造了NEO用于matrix的自动升级 matrix全三集的内容都是在构建一个计算机虚拟世界 影片到最后交代自始至终都没有真正的人类和人类世界的出现 Zion也是只程序的一部分；黑客帝国的结局，就是母体史密斯尼奥全部系统崩溃被删除史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样而在大结局中，尼奥和史密斯；而尼奥与前任们不同的是，建筑师在他的意识中编写了关于爱的编码，这本来是系统处于不断升级的需要，也是考察人类反应的新实验但这个关于爱的编码，不但导致了尼奥在第二集中做出违背程序设置的选择，而且在第三集中将“；结局尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统原因史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥。
因为尼奥在和史密斯最后的决战中，成功的复制了史密斯的代码，然后进行了删除，因此成功的结束了战争在黑客帝国3中，尼奥借由救世主不分世界的超能力成功进入机械城市，但崔妮蒂在此牺牲尼奥进入机器城市后，与身为机器；可惜高兴不到3秒，尼奥史密斯先生就自爆了原因是就我上面想要表达的，史密斯因尼奥存在而存在，现在1没有了，自然就不会有1了因此史密斯的死，依然是母体再平衡机制的结果黑客帝国3矩阵革命The Matrix。
黑客帝国的结局不是输了结局是尼奥和史密斯双双被机器删除，机器撤回电子乌贼大军，人类迎来了和平还有一种对结局背后的推测是实际还是人类输了就是母体为了进化，用人类作为能源，在进化的过程中有一些不肯被删除。