因为主角并不真实存在于环境中，而是他的意识在程序中他们每次执行任务的地方，其实就是母体，母体是一个庞大的模拟程序主角复活后，变成了一种类似于特殊软件的东西，能够看清母体的本质结构了，就是那些代码甚至有了。
1为什么“先知”和“造物主”这些电脑程序都没消失没有消失，因为作为救世主的尼奥并没有消灭源程序即造物主而是跟它达成一个协议，尼奥用自己的生命去帮助造物主消灭已经无法控制的史密斯，而造物主不再攻击锡安的人类。
因为说他是救世主，他人生的最终目的是拯救整个锡安，所以不是不会死的，也就是说他可以选择自己的命运，是生是死自己决定，看到第三部就知道了。
影片黑客帝国是华纳兄弟影片公司1999年的一部动作科幻电影，影片由安迪·沃卓斯基和拉娜·沃卓斯基共同担任导演及编剧，基努·李维斯凯瑞·安·莫斯和劳伦斯·菲什伯恩等联袂出演电影于1999年3月31日在美国上映影片。
当人在矩阵中活动时，肉体与精神分离就像正在拷贝的U盘，强行拔出会导致文件损坏所以说，如果潜入矩阵时被强行拔插头，精神肉体分离，在现实里的人就相当于植物人了而精神将被困在矩阵中。
生与死都由他自己来主宰这一点在黑客帝国第三部中已经做了明确的交代，没有看过第三部影片的小伙伴们可以去看看，非常精彩很多前两部中大家不理解的地方，在第三部中都有很好的诠释尼奥是这部影片的主角，怎么可以。