黑客帝国讲述一名年轻的网络黑客尼奥发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的尼奥在一名神秘女郎崔妮蒂的引导下见到了黑客组织的首领墨菲斯，三人走上了抗争矩阵的征途剧情简介在。
黑客帝国中尼奥在现实世界中有超能力是因为先知告诉他救世主的能力并不仅限于矩阵中，而是可以联系到机器城的源代码特工史密斯通过人类反叛军成员的大脑进入真实世界，随后尼奥在真实世界与史密斯搏斗，被史密斯烧坏了眼睛，但却。
尼奥牺牲自己和病毒特工史密斯 史密斯本来是杀毒程序，在第一集最后被尼奥消灭后变异为病毒同归于尽，矩阵自身无法杀死病毒，设计师老人接受了尼奥的条件，换来了和平所以锡安最后没有灭亡仔细看，第三集最后部分。
黑客帝国4里面的矩阵和前三部的矩阵不是相同设定，要按照新矩阵的规则来推测设定围绕的是艺术表达，而非艺术表达围绕设定在新的矩阵中，是以尼奥和崔尼蒂两个人作为核心来启动的，所以崔尼蒂在新的矩阵中和尼奥一样都。
先知告诉崔尼蒂，她会爱上一个人，而那个人是救世主她想告诉尼欧这个为什么不好，三集里面都没有提到原话，不过总的意思是说他们不会有好的结果，包括后面崔尼蒂的死，尼欧面临的选择等等。
尼奥和特工史密斯的遭遇就象是一个噩梦一样可怕，尼奥也愿意相信这一切不过只是场噩梦而另一个著名黑客莫菲斯的电话让尼奥更加疑惑为了解开这些疑团，他跟随崔尼蒂来到了莫菲斯的房间 尼奥发现自己在一个无法想象的地方醒来，随后发生的。
