黑客帝国的结局，就是母体史密斯尼奥全部系统崩溃被删除史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样而在大结局中，尼奥和史密斯。
可惜高兴不到3秒，尼奥史密斯先生就自爆了原因是就我上面想要表达的，史密斯因尼奥存在而存在，现在1没有了，自然就不会有1了因此史密斯的死，依然是母体再平衡机制的结果黑客帝国3矩阵革命The Matrix。
这意味着电子世界遭受全方位的湮灭与毁坏，甚至出现文明的倒退黑客帝国日渐式微，最终衰败仅仅是时间问题具体表现在，电子世界的代码错乱，机器人行为怪异，以及电子木马程序的肆虐这样的结局，也反映出人类对于人工智能无序。
黑客帝国4结局是neo潜意识以墨菲斯为蓝本创造了一个虚拟人物墨菲斯，把他的使命设定为引导neo反抗墨菲斯和新人类的一只小队从矩阵中救出了neo他们一起引导Trinity逃脱俩人利用自己的权限大杀四方，最后羞辱了一波。
尼奥为了人类和母体的和平 单挑史密斯 故意让史密斯吸收，被电脑重新洗牌删除史密斯，重做世界人类和机器和平共处。