想着消灭这些非法程序，最后就剩下史密斯这个最大的程序史密斯已经变成病毒了，可以毁灭人类和母体建筑师让史密斯复制尼奥，进而一举删除史密斯和尼奥，机器世界得到进化黑客帝国黑客帝国是由华纳兄弟公司发行的系列。
洋葱理论没有证实之前 zion还是真实的 并不是虚拟的 在matrix2里zion看起来的确像是虚拟的 但是到3出现了逆转 neo最后是涅磐了，灵魂的躯壳还有什么用去骇客帝国吧吧，那里你能得到最好的解释。
最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对尼奥的承诺允许那1%的人类永久的生存在锡安中，先知的矩阵革命得以实现最终先知和尼奥共同拯救了人类经典的黑客帝国系列完结。
黑客帝国的结局，就是母体史密斯尼奥全部系统崩溃被删除史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样而在大结局中，尼奥和史密斯。
尼奥Neo最后死掉了他用自己的牺牲换取“真实世界”短暂的和平与安宁电影里一再交代，只要拔下插头就会死掉那个机器帮他把插头拔掉他和同化的“史密斯”一起消失黑客帝国3矩阵革命The Matrix Revolutions。
总之，他的目的和尼奥一样，是取得自己的自由 但是，史密斯的目的是邪恶的，他希望摧毁所有威胁他的人类和机器世界，他的自由只是自己的自由四史密斯为什么可以复制自己 黑客帝国二里面有一段尼奥和一百多个史密斯对决的。
