但是机械主也因此获得了史密斯的代码，从而成功将其清除，在最后一刻拯救了仅存的人类，还有被机器大军破坏殆尽的锡安城，机器世界与真实世界都获得了和平，人类从此可以选择生活在矩阵或现实世界，而造物主也承诺不愿生活在机器。
在矩阵中他们具有改写人类角色程序的能力，所以可以不断借用他人身体，所以也就不会有死亡这个说法影片讲述了一名年轻的网络黑客尼奥发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的，尼奥在一名。
是的，这就是电影的结局先知随着对人类的研究逐渐理解并拥有了人类的情感，这是与同为程序的架构师最大的不同，先知想要终结机器与人类的战争并因此创造出了尼奥和史密斯最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对。
最后尼奥选择了让史密斯感染自己，在复制过程中矩阵掌握了史密斯的代码，最后才得以将他们两个同时删除，使矩阵回到了平衡 尼奥死了后，系统恢复到了以前黑客帝国1的时候，但系统不再升级，机器帝国撤回了机器军队，人类免于毁灭那么也不。
尼奥作为救世主，是被设计师设计出来的，他实质上就是一个程序在第一部中，尼奥死了才触发了救世主的程序，真正成为救世主黑客帝国剧情简介在矩阵中生活的一名年轻的网络黑客尼奥基努·里维斯饰发现，看似正常的。
