合体到母体里了，可以说是死了也可以说还活着；4注入的不是能量，是删除程序，因为史密斯们被锁定了，所以机器以尼奥通道注入删除程序，让史密斯们自爆了下面我把第2问到第4问串联起来详细解释一下黑客帝国3中，尼奥最后到达机器城市，在和机器达成和平的协议时。
电影最后没有明确答复，不过先知对小女孩说我们还能再见到尼奥不过我认为即使他没死，系统的下一任救世主也将不是他了；洋葱理论没有证实之前 zion还是真实的 并不是虚拟的 在matrix2里zion看起来的确像是虚拟的 但是到3出现了逆转 neo最后是涅磐了，灵魂的躯壳还有什么用去骇客帝国吧吧，那里你能得到最好的解释。
因为尼奥在和史密斯最后的决战中，成功的复制了史密斯的代码，然后进行了删除，因此成功的结束了战争在黑客帝国3中，尼奥借由救世主不分世界的超能力成功进入机械城市，但崔妮蒂在此牺牲尼奥进入机器城市后，与身为机器；总之，他的目的和尼奥一样，是取得自己的自由 但是，史密斯的目的是邪恶的，他希望摧毁所有威胁他的人类和机器世界，他的自由只是自己的自由四史密斯为什么可以复制自己 黑客帝国二里面有一段尼奥和一百多个史密斯对决的。
尼奥Neo最后死掉了他用自己的牺牲换取“真实世界”短暂的和平与安宁电影里一再交代，只要拔下插头就会死掉那个机器帮他把插头拔掉他和同化的“史密斯”一起消失黑客帝国3矩阵革命The Matrix Revolutions。
原因史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥的大脑被烧毁直接死亡，而史密斯及其复制品也在源源不断的删除代码中得以删除黑客帝；尼欧突然就打赢了史密斯，和他的身份有关史密斯的“生”第一部最后尼奥觉醒，变成the One ，最后关头通过进入史密斯的身体，篡改了史密斯的程序，认为消灭了史密斯然而在第二部，当尼奥惊讶地发现史密斯并没有死，反而更。
死了 史密斯在被尼奥终结后由于悖论因为在尼奥终结史密斯前是史密斯杀了尼奥，而尼奥的“复活”又是程序设定以外的，所以本应该按程序已死的人反而杀死了杀他的人，这样系统就陷入一个死循环，既编的系统程序无法计算出；其实主要讲的是电脑与人之间的战斗，具有矩阵革命性的黑客帝国三部曲第三部黑客帝国3 矩阵革命，终将这部描述人类与机器之战的史诗影片带向高潮的结局锡安的军队，在志愿者泽诺拉基耶饰和基德克莱顿华生饰。
这为最后尼奥和史密斯同归于尽制造了条件，由于有了条件，人类和机器才有了谈判的砝码，要不然机械大军不把Zion变成肉工厂才怪呢 所以说引用黑客帝国里的一句话就是因果联系，万物有始有终。
最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对尼奥的承诺允许那1%的人类永久的生存在锡安中，先知的矩阵革命得以实现最终先知和尼奥共同拯救了人类经典的黑客帝国系列完结；在矩阵中他们具有改写人类角色程序的能力，所以可以不断借用他人身体，所以也就不会有死亡这个说法影片讲述了一名年轻的网络黑客尼奥发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的，尼奥在一名。
无所谓“死”不死的 NEO本来也是程序的一部分 工程师创造了NEO用于matrix的自动升级 matrix全三集的内容都是在构建一个计算机虚拟世界 影片到最后交代自始至终都没有真正的人类和人类世界的出现 Zion也是只程序的一部分；可惜高兴不到3秒，尼奥史密斯先生就自爆了原因是就我上面想要表达的，史密斯因尼奥存在而存在，现在1没有了，自然就不会有1了因此史密斯的死，依然是母体再平衡机制的结果黑客帝国3矩阵革命The Matrix。
结局尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统原因史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥。
