结局尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统原因史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥。
然而在第二部，当尼奥惊讶地发现史密斯并没有死，反而更强大且具有近乎无敌的复制能力但是尼奥并没真正意识到史密斯是自己的黑暗面或者说是反面化身直到尼奥在第三部中求教先知才得知答案让我们整理下Architect与先知说过。
黑客帝国3，机器准备第七次毁灭锡安人类地心城市人类岌岌可危，根本没有胜算由于伴随neo产生的程序斯密斯总跟neo打的那个已经失控，占领了整个母体机器控制人类的虚拟世界neo冒死去机器城跟机器老大去谈判。
可惜高兴不到3秒，尼奥史密斯先生就自爆了原因是就我上面想要表达的，史密斯因尼奥存在而存在，现在1没有了，自然就不会有1了因此史密斯的死，依然是母体再平衡机制的结果黑客帝国3矩阵革命The Matrix。
其实主要讲的是电脑与人之间的战斗，具有矩阵革命性的黑客帝国三部曲第三部黑客帝国3 矩阵革命，终将这部描述人类与机器之战的史诗影片带向高潮的结局锡安的军队，在志愿者泽诺拉基耶饰和基德克莱顿华生饰。
neo和smith以正负方式相抵消都消失了，机器人停止了攻击人与电脑暂时取得了和平。
不能说活着，但应该也不是死了吧，毕竟他的存在就是为了修复母体，重建ZION，就如前5任救世主所做的一样，但是因为他有爱，和别人不一样，他才选择了和别人不一样的道路所以应该也不能算个真实存在的吧倒下去以后。
尼奥Neo最后死掉了他用自己的牺牲换取“真实世界”短暂的和平与安宁电影里一再交代，只要拔下插头就会死掉那个机器帮他把插头拔掉他和同化的“史密斯”一起消失黑客帝国3矩阵革命The Matrix Revolutions。
最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对尼奥的承诺允许那1%的人类永久的生存在锡安中，先知的矩阵革命得以实现最终先知和尼奥共同拯救了人类经典的黑客帝国系列完结。
接楼上的，因为NEO帮机器皇帝灭了SMITH机器皇帝自己灭不了，机器皇帝就答应了他的条件，就是锡安的和平所以 梅屈克斯 锡安都还在，就是NEOSMITH死了。
但是使史密斯再后来变得更强以至于威胁到了母体的存在，这为最后尼奥和史密斯同归于尽制造了条件，由于有了条件，人类和机器才有了谈判的砝码，要不然机械大军不把Zion变成肉工厂才怪呢 所以说引用黑客帝国里的一句话就是因果。
黑客帝国的结局，就是母体史密斯尼奥全部系统崩溃被删除史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样而在大结局中，尼奥和史密斯。
不如第一部，结局是neo和smith同归于尽，锡安和matrix被救。
这就是黑客帝国的大背景然而第N代the one的Neo具体是第几代我记不太清了，打破了人工智能自己创造出的平衡，这便是第二部的结局与第三步开端的背景，同时造物主还可以创造出不同的人工智能，比如先知法国人。
4注入的不是能量，是删除程序，因为史密斯们被锁定了，所以机器以尼奥通道注入删除程序，让史密斯们自爆了下面我把第2问到第4问串联起来详细解释一下黑客帝国3中，尼奥最后到达机器城市，在和机器达成和平的协议时。